Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8CD60 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8CD60 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8CD60 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8CD60 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8CD60 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8CD60 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8CD60 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8CD60 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8CD60 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8CD60 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8CD60 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8CD60 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8CD60 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8CD60 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8CD60 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8CD60 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8CD60 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8CD60 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms