Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms