Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms