Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a6Q8C6K9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col6a6Q8C6K9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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