Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms