Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms