Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms