Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Hdac7Q8C2B3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Hdac7Q8C2B3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Hdac7Q8C2B3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hdac7Q8C2B3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hdac7Q8C2B3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hdac7Q8C2B3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hdac7Q8C2B3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hdac7Q8C2B3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hdac7Q8C2B3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac7Q8C2B3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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