Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms