Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prpf18Q8BM39 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prpf18Q8BM39 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prpf18Q8BM39 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prpf18Q8BM39 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prpf18Q8BM39 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prpf18Q8BM39 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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