Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Clrn3Q8BHH8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Clrn3Q8BHH8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Clrn3Q8BHH8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Clrn3Q8BHH8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Clrn3Q8BHH8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Clrn3Q8BHH8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn3Q8BHH8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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