Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmco3Q8BH01 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms