Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGP6

Slc25a40, Solute carrier family 25 member 40, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a40Q8BGP6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc25a40Q8BGP6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms