Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms