Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.5Q85ZW7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms