Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc50Q810U5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms