Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Smim19Q80ZU4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Smim19Q80ZU4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Smim19Q80ZU4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Smim19Q80ZU4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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