Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms