Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NischQ80TM9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
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