Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IfnkQ7TSL0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms