Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1cQ7TSF0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1cQ7TSF0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms