Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms