Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms