Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4bQ7M729 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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