Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms