Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27lQ6ZWY3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms