Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih3Q6ZWS4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms