Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Syne1Q6ZWR6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms