Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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