Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tfap2eQ6VUP9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms