Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dtx4Q6PDK8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms