Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap20Q6IFT4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms