Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms