Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms