Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Sema3cQ62181 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Sema3cQ62181 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sema3cQ62181 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Sema3cQ62181 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Sema3cQ62181 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Sema3cQ62181 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms