Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms