Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli3Q61602 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms