Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2bQ61313 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms