Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms