Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim2Q61079 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim2Q61079 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms