Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms