Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ItgaeQ60677 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms