Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SkilQ60665 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SkilQ60665 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SkilQ60665 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SkilQ60665 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SkilQ60665 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SkilQ60665 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SkilQ60665 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkilQ60665 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms