Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms