Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a6Q5U4D8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a6Q5U4D8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms