Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp28Q5I043 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp28Q5I043 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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