Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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