Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms