Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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