Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pydc3Q3V3Q4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms